论文被盗会严重影响查重结果的准确性，因为盗版论文与原创论文内容高度相似，容易被查重系统误判为抄袭。为防止论文被盗，作者应加强文献保密意识，避免将未发表论文随意传播。另外，定期检查论文是否被非法下载，确保自身版权不受侵犯。此外，可以选择将论文上传至正规的学术平台，提高论文的知名度，降低被盗风险。

为防止论文被盗，作者还可以采取一些技术手段，如在论文中嵌入特定标识符进行版权保护，限制文档的阅读权限，设置访问密码等。此外，定期使用专业的查重软件对论文进行自查，及时发现盗版行为。同时，加强对学术诚信的培养，提高学术道德意识，共同维护学术环境的纯净。只有保护好自己的论文版权，才能有效避免论文被盗对查重带来的负面影响。